The complete genome sequence of Neckar River virus confirms it to be a distinct member of the genus Tombusvirus in the family Tombusviridae

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Tran, T.C.; Maiss, E.; Rose, H.: The complete genome sequence of Neckar River virus confirms it to be a distinct member of the genus Tombusvirus in the family Tombusviridae. In: Archives of Virology (Formerly: Archiv für die gesamte Virusforschung) 168 (2023), Nr. 12, 296. DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-023-05918-z

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Neckar River virus (NRV), first isolated from a water sample of the Neckar River (Germany) in the 1980s, was serologically characterized as a novel tombusvirus. In this study, the complete genome sequence was determined, and an infectious full-length cDNA clone was constructed. The genome organization of NRV (DSMZ PV-0270) resembles that of tombusviruses. The genome consists of 4739 nucleotides and contains five open reading frames (ORFs) and one additional putative ORF (pX) in the 3’-terminal region. Phylogenetic analysis and sequence comparisons confirmed NRV to be a member of the species Tombusvirus neckarfluminis in the genus Tombusvirus. The infectious full-length cDNA clone was constructed using Gibson assembly and subsequent infection of Nicotiana benthamiana plants by Rhizobium radiobacter inoculation. The virus derived from the full-length cDNA clone caused symptoms resembling those caused by the wild-type virus, but slightly milder.
Lizenzbestimmungen: CC BY 4.0 Unported
Publikationstyp: Article
Publikationsstatus: publishedVersion
Erstveröffentlichung: 2023
Die Publikation erscheint in Sammlung(en):Naturwissenschaftliche Fakultät

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